近年来，内蒙古鸿茅药业响应国家绿色低碳的发展要求，顺应全球绿色发展的大趋势，连续多年投入巨资对生产基地进行升级，打造“绿色工厂”。

2020年，鸿茅药业被评为“内蒙古自治区绿色工厂”。鸿茅药业认真贯彻落实国家“节约、清洁、安全”三大能源战略方针和“节能优先、绿色低碳、立足国内、创新驱动”四大能源发展战略。鸿茅药业为建设“绿色工厂”，在基地建设、生产线改造、流程升级、废物转化、节能减排等方面，做了很多具体的工作，在药酒行业中属于较早一批实现“绿色工厂”的企业，在中药生产行业中起到了示范带头作用。

鸿茅药业在能源消耗和高能耗设备改造更新换代项目中投入大量资金，在生态环保、节能减排方面，先后投资8000万元，用于更新设备设施，提高废物处理能力，使各类污水、废气、固废等都得到了有效处理和回收。2016年扩建和改造污水处理站，新增在线监测和在线处理系统；2017年修建100吨冷却水循环池，年节约水7000吨；2018年完成“煤改气”项目；2015年至2020年采购节能的空调和电器替代能耗高的设备，大幅减少电能的使用。

鸿茅药业已经形成了“绿色研发-绿色应用-绿色推广”的良性绿色制造模式。在产品设计开发阶段系统考虑从原材料到生产等所有环节对资源环境造成的影响，实现产品对能源资源消耗最低化、生态环境影响最小化、可再生率最大化。

鸿茅药业借力数字信息化实现创新转型，实现制造物流质量的精细化、透明化、自动化、实时化、数据化、一体化管理，提供了产品生命周期内的可追溯能力，确保从产品生产、产品出库到市场流通各环节的全过程可追溯性。不但形成信息数据化，还大幅减少了人力、物力、运力的消耗，将节能减排落实到位。